Abstract:
Ikan gabus merupakan ikan air tawar yang dimanfaatkan pada bidang kesehatan dan farmasi yang diasosiasikan sebagai obat karena kandungan yang dimilikinya telah terbukti secara klinis pada beberapa penyakit. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi peptida aktif dari myosin ikan gabus (Channa striata) dan mengetahui interaksi peptida aktif sebagai ligan dengan reseptor protein yang berperan pada regulasi sel kanker menggunakan metode molecular docking. Sekuen protein myosin diperoleh dari database uniprotKB. Skrining peptida menggunakan web server peptide cutter, biopep- UWM, innovagen AB, allerTOP, dan toxinpred. Docking molecular menggunakan server swissdock dan sifat fisikokimia peptide ditentukan dengan serever swissADME. Hasil skrining menunjukkan sebelas peptide aktif dari anti ikan gabus, yaitu AK, IR, EA, QK, QR, AER, VIQ, DTSK, SPEEK,TPEEK dan EEQAEPDGTEAADK. Hasil docking molecular menunjukkan bahwa ligan AK (alanil-lysine) berinteraksi sangat kuat dengan protein tirosin kinase (PDB ID: 6Z4D) menghasilkan nilai energi ikatan (?G) sebesar -9.72 kkal/mol. Residu asam amino dari tirosin kinase yang berikatan hidrogen dengan ligan: Lys-716, Asp-800 dan Glu-804 (2 ikatan), berinteraksi hidrofobik: Val-717, Ser-720, Glu-804, Tyr-801, His-805, Pro-794 dan Phe-795. Peptida AK secara in silico memiliki potensi sebagai antikanker dengan menghambat kerja protein tirosin kinase.
