Abstract:
PENENTUAN LAJU MUTASI DAN PUSAT SEBARAN FRAGMEN
CYTOCHROME C OXIDASE SUBUNIT I (Co I) mtDNA AUROCH DARI
GENBANK NCBI (Oleh Ainun Jariyah; Pembimbing: Tanto Budi Susilo; 2023;
52 halaman)
Auroch membutuhkan asupan energi yang cukup ketika bermigrasi, Adenosin
Trifosfat (ATP) berperan dalam proses perubahan energi baik untuk menyimpan
atau melepaskan energi dari tubuh. Tujuan penelitian adalah mengetahui jarak
genetik fragmen Co I mtDNA dan pusat sebaran Auroch. Gen Co I mengkode
protein pada subunit dari enzim yang berperan sebagai transpor elektron dalam
proses transpor pada membran mitokondria, dan berperan penting dalam
menghasilkan ATP. Sampel yang digunakan pada penelitian ini berjumlah 73 dari
benua Eropa, Asia dan Afrika. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode Nei
dan ANN, dengan mengaplikasikan Microsoft Excel, MAFFT, UGENE dan
MATLAB R2020b. Hasil perhitungan jarak genetik individu menunjukkan nilai
tertinggi yaitu 20, seperti pada individu dengan kode akses MZ901672 terhadap
MF667932, sedangkan nilai terendah menunjukkan 0, seperti pada perbandingan
individu GQ129208 dengan MT576844. Hasil perhitungan jarak populasi
menunjukkan nilai tertinggi adalah 5.8058 pada populasi Asia-Auroch, sedangkan
nilai terendah adalah 0.1994 pada populasi Eropa-Afrika. Hasil ini menunjukkan
bahwa pusat sebaran sapi berada di Asia. Selanjutnya, perhitungan laju mutasi
menggunakan perbandingan umur fosil terhadap jarak genetika populasi asia
adalah 1.160-258,36 tahun/mutasi. Perbandingan urutan asam amino (ADE05529)
sebagai pembanding terhadap 3 jenis sekuen yang bermutasi menunjukkan
perbedaan pada urutan 56, 407, dan 509. Perbedaan ini disebut sebagai missense
mutation, yaitu perubahan susunan basa nitrogen yang menyebabkan asam amino
pada rantai polipeptida berubah.
Keywords: Auroch, CO I, Fragmen Co I mtDNA
